Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYF6P23409 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYF6P23409 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYF6P23409 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYF6P23409 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYF6P23409 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYF6P23409 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYF6P23409 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYF6P23409 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYF6P23409 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYF6P23409 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYF6P23409 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYF6P23409 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYF6P23409 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYF6P23409 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYF6P23409 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYF6P23409 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYF6P23409 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYF6P23409 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MYF6P23409 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MYF6P23409 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYF6P23409 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYF6P23409 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYF6P23409 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYF6P23409 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYF6P23409 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYF6P23409 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYF6P23409 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYF6P23409 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYF6P23409 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYF6P23409 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYF6P23409 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYF6P23409 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYF6P23409 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYF6P23409 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms