Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD247P20963 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD247P20963 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CD247P20963 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD247P20963 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CD247P20963 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD247P20963 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD247P20963 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD247P20963 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CD247P20963 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CD247P20963 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD247P20963 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD247P20963 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD247P20963 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD247P20963 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD247P20963 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD247P20963 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD247P20963 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD247P20963 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD247P20963 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD247P20963 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD247P20963 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD247P20963 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD247P20963 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD247P20963 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD247P20963 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD247P20963 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD247P20963 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms