Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms