Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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