Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA6P17658 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA6P17658 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA6P17658 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA6P17658 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA6P17658 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA6P17658 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA6P17658 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA6P17658 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA6P17658 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA6P17658 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA6P17658 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA6P17658 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA6P17658 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA6P17658 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA6P17658 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms