Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB1P16220 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB1P16220 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB1P16220 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB1P16220 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB1P16220 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB1P16220 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB1P16220 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB1P16220 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB1P16220 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB1P16220 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB1P16220 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB1P16220 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREB1P16220 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CREB1P16220 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CREB1P16220 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CREB1P16220 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CREB1P16220 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CREB1P16220 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CREB1P16220 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CREB1P16220 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CREB1P16220 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CREB1P16220 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CREB1P16220 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CREB1P16220 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CREB1P16220 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CREB1P16220 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CREB1P16220 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CREB1P16220 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms