Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms