Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms