Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BMP3P12645 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BMP3P12645 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BMP3P12645 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BMP3P12645 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BMP3P12645 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BMP3P12645 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BMP3P12645 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BMP3P12645 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BMP3P12645 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMP3P12645 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BMP3P12645 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms