Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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