Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB1P11230 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHRNB1P11230 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHRNB1P11230 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms