Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms