Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NGFRP08138 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NGFRP08138 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NGFRP08138 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NGFRP08138 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NGFRP08138 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NGFRP08138 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NGFRP08138 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NGFRP08138 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NGFRP08138 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms