Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFMP07197 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFMP07197 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFMP07197 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEFMP07197 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEFMP07197 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEFMP07197 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEFMP07197 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEFMP07197 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEFMP07197 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFMP07197 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFMP07197 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFMP07197 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFMP07197 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFMP07197 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFMP07197 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFMP07197 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFMP07197 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFMP07197 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFMP07197 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFMP07197 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFMP07197 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFMP07197 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFMP07197 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFMP07197 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFMP07197 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFMP07197 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFMP07197 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms