Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms