Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSD2O96028 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSD2O96028 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSD2O96028 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSD2O96028 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSD2O96028 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSD2O96028 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSD2O96028 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSD2O96028 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSD2O96028 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSD2O96028 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSD2O96028 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSD2O96028 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSD2O96028 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSD2O96028 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSD2O96028 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSD2O96028 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSD2O96028 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSD2O96028 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSD2O96028 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSD2O96028 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSD2O96028 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSD2O96028 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSD2O96028 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSD2O96028 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSD2O96028 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSD2O96028 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSD2O96028 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSD2O96028 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSD2O96028 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSD2O96028 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSD2O96028 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NSD2O96028 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSD2O96028 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSD2O96028 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSD2O96028 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSD2O96028 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSD2O96028 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSD2O96028 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSD2O96028 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSD2O96028 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSD2O96028 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSD2O96028 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSD2O96028 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSD2O96028 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSD2O96028 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSD2O96028 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSD2O96028 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSD2O96028 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSD2O96028 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NSD2O96028 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSD2O96028 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSD2O96028 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSD2O96028 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSD2O96028 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSD2O96028 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSD2O96028 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSD2O96028 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSD2O96028 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NSD2O96028 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSD2O96028 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NSD2O96028 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NSD2O96028 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSD2O96028 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NSD2O96028 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSD2O96028 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSD2O96028 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSD2O96028 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSD2O96028 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSD2O96028 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSD2O96028 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSD2O96028 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSD2O96028 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSD2O96028 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSD2O96028 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSD2O96028 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSD2O96028 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSD2O96028 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSD2O96028 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSD2O96028 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSD2O96028 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSD2O96028 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSD2O96028 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSD2O96028 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSD2O96028 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSD2O96028 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSD2O96028 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NSD2O96028 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSD2O96028 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSD2O96028 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSD2O96028 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSD2O96028 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSD2O96028 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSD2O96028 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NSD2O96028 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSD2O96028 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSD2O96028 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSD2O96028 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSD2O96028 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSD2O96028 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms