Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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