Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms