Protein–RNA interactions for Protein: O75665

OFD1, Oral-facial-digital syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OFD1O75665 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OFD1O75665 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OFD1O75665 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OFD1O75665 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OFD1O75665 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OFD1O75665 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OFD1O75665 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OFD1O75665 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OFD1O75665 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OFD1O75665 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OFD1O75665 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OFD1O75665 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OFD1O75665 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OFD1O75665 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OFD1O75665 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OFD1O75665 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OFD1O75665 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OFD1O75665 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OFD1O75665 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OFD1O75665 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OFD1O75665 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OFD1O75665 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OFD1O75665 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OFD1O75665 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OFD1O75665 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OFD1O75665 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OFD1O75665 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OFD1O75665 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OFD1O75665 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OFD1O75665 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OFD1O75665 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
OFD1O75665 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OFD1O75665 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OFD1O75665 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OFD1O75665 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OFD1O75665 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OFD1O75665 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OFD1O75665 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OFD1O75665 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OFD1O75665 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OFD1O75665 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OFD1O75665 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OFD1O75665 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
OFD1O75665 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OFD1O75665 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
OFD1O75665 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OFD1O75665 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OFD1O75665 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OFD1O75665 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OFD1O75665 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OFD1O75665 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OFD1O75665 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OFD1O75665 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OFD1O75665 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OFD1O75665 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OFD1O75665 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OFD1O75665 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OFD1O75665 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OFD1O75665 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OFD1O75665 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OFD1O75665 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OFD1O75665 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
OFD1O75665 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OFD1O75665 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
OFD1O75665 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OFD1O75665 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OFD1O75665 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OFD1O75665 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OFD1O75665 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OFD1O75665 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
OFD1O75665 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
OFD1O75665 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
OFD1O75665 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
OFD1O75665 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OFD1O75665 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OFD1O75665 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
OFD1O75665 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
OFD1O75665 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
OFD1O75665 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OFD1O75665 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OFD1O75665 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OFD1O75665 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OFD1O75665 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OFD1O75665 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OFD1O75665 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OFD1O75665 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OFD1O75665 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OFD1O75665 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OFD1O75665 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OFD1O75665 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OFD1O75665 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OFD1O75665 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OFD1O75665 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OFD1O75665 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OFD1O75665 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OFD1O75665 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OFD1O75665 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OFD1O75665 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OFD1O75665 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OFD1O75665 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms