Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms