Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms