Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNMO15061 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNMO15061 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNMO15061 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNMO15061 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNMO15061 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNMO15061 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNMO15061 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNMO15061 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNMO15061 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNMO15061 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNMO15061 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNMO15061 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNMO15061 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNMO15061 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNMO15061 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNMO15061 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNMO15061 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNMO15061 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNMO15061 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNMO15061 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNMO15061 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNMO15061 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNMO15061 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNMO15061 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNMO15061 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNMO15061 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNMO15061 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNMO15061 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNMO15061 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNMO15061 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNMO15061 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNMO15061 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNMO15061 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNMO15061 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNMO15061 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNMO15061 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNMO15061 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNMO15061 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNMO15061 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNMO15061 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNMO15061 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNMO15061 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNMO15061 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNMO15061 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNMO15061 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNMO15061 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNMO15061 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNMO15061 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNMO15061 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNMO15061 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNMO15061 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNMO15061 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNMO15061 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNMO15061 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNMO15061 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNMO15061 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNMO15061 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNMO15061 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNMO15061 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNMO15061 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNMO15061 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNMO15061 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNMO15061 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNMO15061 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNMO15061 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNMO15061 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNMO15061 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNMO15061 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNMO15061 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNMO15061 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNMO15061 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNMO15061 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNMO15061 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNMO15061 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNMO15061 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNMO15061 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNMO15061 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNMO15061 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNMO15061 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNMO15061 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNMO15061 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNMO15061 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNMO15061 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms