Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRPO00591 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRPO00591 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRPO00591 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRPO00591 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRPO00591 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRPO00591 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRPO00591 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRPO00591 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRPO00591 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRPO00591 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRPO00591 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRPO00591 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRPO00591 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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GABRPO00591 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRPO00591 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRPO00591 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRPO00591 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRPO00591 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRPO00591 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRPO00591 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRPO00591 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRPO00591 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRPO00591 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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