Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258 ms