Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms