Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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