Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP27XA6NNY8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP27XA6NNY8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP27XA6NNY8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP27XA6NNY8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP27XA6NNY8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP27XA6NNY8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP27XA6NNY8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP27XA6NNY8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP27XA6NNY8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP27XA6NNY8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP27XA6NNY8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP27XA6NNY8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP27XA6NNY8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP27XA6NNY8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP27XA6NNY8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP27XA6NNY8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP27XA6NNY8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP27XA6NNY8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP27XA6NNY8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP27XA6NNY8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP27XA6NNY8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP27XA6NNY8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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USP27XA6NNY8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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USP27XA6NNY8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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USP27XA6NNY8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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USP27XA6NNY8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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USP27XA6NNY8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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USP27XA6NNY8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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USP27XA6NNY8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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USP27XA6NNY8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP27XA6NNY8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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