Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms