Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP69A5D8W1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms