Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WW87

IGKV2-40, Immunoglobulin kappa variable 2-40, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV2-40A0A087WW87 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
IGKV2-40A0A087WW87 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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