Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms