Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF330Q9Y3S2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms