Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC2Q9Y2U9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms