Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms