Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms