Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNPO2Q9UMS6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms