Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMCC3Q9ULS5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMCC3Q9ULS5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms