Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR5

CKLF, Chemokine-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKLFQ9UBR5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKLFQ9UBR5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms