Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms