Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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