Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PARVAQ9NVD7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PARVAQ9NVD7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PARVAQ9NVD7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PARVAQ9NVD7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PARVAQ9NVD7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PARVAQ9NVD7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PARVAQ9NVD7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PARVAQ9NVD7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PARVAQ9NVD7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PARVAQ9NVD7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PARVAQ9NVD7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms