Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms