Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCDHB16Q9NRJ7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms