Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLE3Q9NRF9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms