Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms