Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms