Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms