Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms