Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms