Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms